原理：RNA純化的染色質(zhì)分離技術(shù)（Chromatin isolation by RNA purification，ChIRP）方法是通過(guò)設(shè)計(jì)生物素或鏈霉親和素探針，把目標(biāo)RNA拉下來(lái)以后，與其共同作用的DNA染色體片段或蛋白質(zhì)就會(huì)附在到磁珠上，最后把染色體片段或蛋白質(zhì)做高通量測(cè)序或質(zhì)譜分析，這樣會(huì)明確目標(biāo)RNA能夠結(jié)合到在基因組的哪些區(qū)域。

應(yīng)用：

主要用于在全基因組范圍內(nèi)鑒定RNA與染色質(zhì)的互作。長(zhǎng)非編碼RNA（lncRNA）是長(zhǎng)達(dá)兩百個(gè)核苷酸以上的轉(zhuǎn)錄本。雖然lncRNA沒(méi)有編碼任何蛋白質(zhì)，但它們?cè)诓煌M織和發(fā)育階段的表達(dá)依然具有特異性，這說(shuō)明lncRNA具有重要的生物學(xué)意義。細(xì)胞中絕大多數(shù)lncRNA位于細(xì)胞核，它們對(duì)應(yīng)的DNA區(qū)域有的與蛋白編碼基因重疊，有的位于基因間或者內(nèi)含子中。在測(cè)序技術(shù)的幫助下，人們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)千種lncRNA，但這些lncRNA的生物學(xué)功能依然還是個(gè)謎。眾所周知，要了解一個(gè)分子的功能，可以去找它的搭檔。2011年，斯坦福大學(xué)的Howard Chang教授開發(fā)了ChIRP技術(shù)，該技術(shù)可以在全基因組范圍內(nèi)鑒定RNA與染色質(zhì)的互作，被不同領(lǐng)域的研究者們廣泛采用。

?

經(jīng)典文獻(xiàn)：

Ci Chu et al. Genomic maps of lincRNA occupancy reveal principles of RNAchromatininteractions.Mol Cell. 2011; 44(4): 667–678.

?

服務(wù)模式：

客戶提供：
①　活細(xì)胞：培養(yǎng)細(xì)胞至60－80％密度，然后加滿培養(yǎng)基寄給公司；
②　培養(yǎng)基信息；
③　miRNA基因信息、物種信息及ID。

?

公司提供：

實(shí)驗(yàn)報(bào)告（材料、試劑、儀器、方法、數(shù)據(jù)分析、實(shí)驗(yàn)結(jié)果）。